疾控中心实验室的建设是一个分工极细、专业极强、施工技术极高的生物医疗工程。设计中还要注意到：
（1）征求使用者和操作者的意见，确定工艺流程图；
（2）按照四类病原体的特性和污染途径，确定控制技术方案和灭菌杀菌方案；
（3）根据气溶胶特性和实验操作的危险，制定出洁净度、气流流向、流速和压差梯度参数；
（4）有实验动物的实验室自成一区，独立传递，动物尸体要完全焚尸灭菌后，才能传出；
（5）确定所有的实验设备、工具、箱柜、台案数量和尺寸；
（6）确定实验室的预警、关闭、自救和逃生方案；
1.人流和物流
 (1) 人流：
   初更室—气闸更衣室—淋浴更衣室—缓冲室—进入实验区。离开时进入净身室（房间负压），脱下身上所有的衣物，衣物放入双门药液浸泡柜（或其他方式消毒柜）内（双门药液浸泡柜的门设计成控制式的，不允许同时打开）；然后进入淋浴室淋浴；淋浴后进入记录室，登记记录自己的工作和身体污染情况，然后拿着身体状况表进入体检室，作污染和常规检查或住室观察，无问题进入气闸更衣室换上自己的衣服下班。
（2）物流
   物流：设计成单向性的，从专门的库房（或暂存间）进入缓冲间，再进入实验室。离开时必须通过双门热压灭菌锅进入另一个缓冲间（双门热压灭菌柜的门设计成控制式的，不允许同时打开）。任何物料只要进入是实验区，不能原路返回。
（3）三废处理
 a.废液   废液处理的方法是根据废液的性质确定的处理方法的。一般采取的方法有：化学处理方法、物理处理方法、生物处理方法。
 b.废气   废气处理可采用的方法有：加热灭菌方法、高效过滤器方法、混合灭菌方法、火焰灭菌方法等。
 c.固体废料   固体废料的处理方法有：蒸汽灭菌方法、气体熏蒸方法、液体浸泡方法、辐射灭菌方法、焚烧处理方法等。
2.建筑
  主体结构采用土建方法，有抗8级以上地震能力，在温度变化和振动情况下不产生裂纹和缝隙，建筑为单层和多层均可。最好是独立的多层建筑，按工艺要求分层划区，便于实验和管理。
(1)墙板和顶板 室内装修材料与洁净厂房的装修材料不一样，彩钢复合板不宜在疾控中心实验室中使用；原因在于板与板之间的插接缝隙太大，虽然打胶密封，但在四季温度变化中很快裂出缝隙。
参考方法：
   a.装修的墙板和顶板可采用机加工金属板方法。四边制成有密封垫的咬口槽，通过卡口槽密封，房间的阴仰角制成120度角的斜边；他的特点在于卡口严密，螺栓紧固密封，无渗漏，不受温度影响，不怕撞击变形，强度大。缺点是装配速度和机加工速度慢些。

b.装修可分成两部分，净化区采用彩钢复合板，污染区和半污染区采用第一方法。

c.在土建过程中墙壁预埋下金属构件，打不透眼孔，攻丝；顶棚与技术夹层采用钢筋水泥浇注，预留下孔洞，埋下金属构件；墙壁和顶棚表面涂胶粘贴不锈钢板，板与板之间采用不锈钢板压条，注胶，用螺栓紧固密封；阴仰角采用圆弧R50金属材料，特殊加工后，粘贴在墙角上。
   d.在土建过程中的墙壁和顶棚上预埋下塑料构件，装修时焊接塑料版，阴仰角用塑料板加工制作，防静电可镶嵌金属条，地面作成防静电地板或金属地板。
   e.其他材料，可选用表面光洁、平整、无缝隙、不起灰、耐腐蚀、耐冲击、易清洗的材料。
(2)地面 地面应光滑、平整、不起灰、耐腐蚀、耐冲击、不积聚静电、易除尘清洗。
(3)根据病原性微生物的生物危害和致病特点，要合理匹配实验室房间和净化设施，每个实验项目与净化设施要自成系统，而且操作中的传递距离要最近，最好是在净化设施内传递，这样净化设备可以制造成群组性的，传递停留处设有气闸仓，而且每个实验阶段的净化设备要独立房间自成系统，房间之间用气闸仓连接，防止环境污染。